まず、質問の前半ですが毎年尿素呼気試験を受けていたのでしょうか？毎年受けていて、今年初めて陽性になった場合はピロリ菌に感染した可能性があります。この質問からですと、これまでの検査の仕方がわかりませんので、なんとも言えません。
次に、除菌中の話ですが、できるだけ胃内の酸性度合いを減らした方が除菌率が上がります。
そのため、和食中心の食事をお勧めしています。
また、除菌に使う胃薬は内服に問題なければ、タケキャブ（ボノプラザン）を強くお勧めします。
頑張ってください。