尿素呼気試験に使用されるユービットという錠剤は、妊婦さんに禁忌（使用してはいけない）というものではありませんが、添付文章上は安全性が確立されていないとされています。ご心配もあるでしょうし、除菌判定は便中抗原検査で行われてはどうですか？これなら便を提出するだけなので全く問題ないです。安定を
　あと、付け加えるなら除菌後１ヶ月で保険上は除菌判定が行えますが、偽陽性や偽陰性を極力なくすために、除菌後２ヶ月以降での除菌判定をお勧めします。