ピロリ菌がいなくなっても、萎縮性胃炎（ピロリ菌により引き起こされた胃炎）はすぐにはよくなりません。
今回の胃カメラで萎縮の程度は前回に比べてどうだったのでしょうか？
改善が見られているなら、特にピロリ菌の再検査は必要ないです。ピロリ菌が除菌までにした悪さの名残だと考えられます。
もし、全く改善が見られなかったり、逆に悪化してるのであれば再検査してもいいと思います。
この萎縮をすぐによくするお薬は今のところありません。
定期的に胃カメラをして、万が一の場合でも早期に対応できるようにすることが肝心です。
kuroさんはお若くして除菌されていますので、おそらく萎縮の程度も軽いでしょうし、早く萎縮が改善する場合が多いですよ。
胃カメラでの経過観察頑張ってください。