LG21で、感染判定に問題が出ることはまずないです。
特に今回のケースでは血液検査ということなので、おそらく血中ピロリ抗体を調べていると思いますが、
抗体の値は２週間程度では下がりませんので、そういう意味からもこの結果はLG21の影響は受けていないと思います。
ただし、LG21とは関係なく、抗体検査には偽陰性（本来は陽性なのに検査上、陰性）の可能性がありますので、通常ピロリ菌の感染診断は２種類の検査を組み合わせて行うことが多いです。尿素呼気試験か便中ピロリ抗原検査で再検査することをお勧めします。