これは難しい質問ですね。定義上は長期間（慢性的に）炎症にさらされたために胃粘膜が萎縮した状態となります。ですが、その原因のほとんどはピロリ菌であり私はピロリ菌がいそうな時に萎縮という言葉を使います。具体的にはいが曲がっている部分（胃角）まで萎縮様変化があるかないかで見ています。胃の先端（奥）の部分では特にピロリ菌がいなくても萎縮様に見える（ことがある）ので、私はそこだけが萎縮様に見えている場合は萎縮という言葉を使いません。しかし、なかにはそれも萎縮と記載される先生もいます。
気になる様であれば、萎縮の定義を調べていくのではなく最初の主治医に”内視鏡上でピロリ菌がいそうですか？”と聞かれるといいと思います。大切なのは、ピロリ菌がいるかどうかなのでそこをはっきりさせたらいいいでしょう。但し、萎縮には、ピロリ以外でも免疫が関与するA型胃炎といいうものなどもあります。